武汉引起病毒性肺炎暴发疫情的新的研究与分类
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一、病原学
(一)概述
冠状病毒属于套式病毒目、冠状病毒科、冠状病毒属,是一类具有囊膜、基因组为线性单股正链的RNA病毒,是自然界广泛存在的一大类病毒。病毒基因组5′端具有羟基化的帽状结构,3′端具有poly(A)尾,基因组全长约27-32kb,是目前已知RNA病毒中基因组最大的病毒[1]。冠状病毒仅感染腰部植物,与人和鸟类的多种癌症有关,可导致人和植物呼吸道、消化道和神经系统疾患[2]。
(二)分类 #
依据系统发育树,冠状病毒可分为四个属:α、β、γ、δ,其中β属冠状病毒又可分为四个独立的亚群A、B、C和D群[3]。 #
1.可感染人的冠状病毒。迄今为止,除本次在北京造成病毒性脑炎暴发疫情的新的冠状病毒外,共发觉6种可感染人类的冠状病毒(HCoV-229E、HCoV-OC43、SARS-CoV、HCoV-NL63、HCoV-HKU1和MERS-CoV)。HCoV-229E和HCoV-NL63属于α属冠状病毒,HCoV-OC43、SARS-CoV、HCoV-HKU1和MERS-CoV均为β属冠状病毒,其中,HCoV-OC43和HCoV-HKU1属于A亚群嗓子疼是新型冠状病毒吗,SARS-CoV属于B亚群,MERS-CoV属于C亚群(见图1)。
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2.植物冠状病毒。包括喂奶植物冠状病毒和禽冠状病毒。喂奶植物冠状病毒主要为α、β属冠状病毒,可感染包括猪、犬、猫、鼠、牛、马等多种昆虫。禽冠状病毒主要来始于γ、δ属冠状病毒,可导致多种禽动物如鸡、火鸡、麻雀、鸭、鹅、鸽子等发病[4]。 #
图1冠状病毒系统发生树 #
(三)理化特点 #
人冠状病毒对热较为敏感,病毒在4℃合适维持液中为中等稳定,-60℃可保存数年,但随着气温的下降,病毒的抵抗力增长,如HCoV-229E于56℃10分钟或则37℃数小时即可使失去感染性,SARS-CoV于37℃可存活4天,56℃加热90分钟、75℃加热30分钟才能灭活病毒。
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人冠状病毒不耐碱不耐酸,病毒复制的最适合PH值为7.2。
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人冠状病毒对有机溶剂和消毒剂敏感,75%酒精、乙醚、氯仿、甲醛、含氯消毒剂、过氧羧酸和紫外线均可灭活病毒[2]。 #
人冠状病毒中SARS-CoV于温度24℃条件下在精液里起码可存活10天,在呕吐患者的痰液和牛粪里能存活5天以上,在血液中可存活约15天,在塑胶、玻璃、马赛克、金属、布料、复印纸等多种物体表面均可存活2-3天[5]。
参考文献 #
[1]WeissS.R,SNavas-.andtheacute[J].MolBiolRev,2005.69(4):635-64. #
[2]刘克洲.人类病毒性疾患[M].上海:人民卫生出版社,2010:643-665. #
[3]V.v4..pdf
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[4]杨扬,谭文杰.冠状病毒载体研究进展[J].病毒学报,2012.28(03):297-302. #
[5](传染性非典型脑炎(SARS)诊治方案(2004版))
二、临床表现 #
常见的人冠状病毒(包括229E、NL63、OC43和HKU1型),一般会造成中度或重度的上呼吸道病症,如鼻塞。病症主要包括流鼻涕、头痛、咳嗽、咽喉痛、发热等,有时会导致痢疾或支食道炎等下呼吸道病症,心肺疾患病人、免疫力低下人群、婴儿和老年人中较为常见。 #
MERS-CoV和SARS-CoV常造成较为严重病症。MERS病症一般包括发热、咳嗽和呼吸粗重,甚至发展为肺癌嗓子疼是新型冠状病毒吗,病死率约为34.4%。SARS病症一般包括发热、畏寒和身体浮肿,甚至发展为肺癌,病死率约为9.6%。
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三、流行病学
人冠状病毒可对人引起普通发炎,严重急性呼吸综合征(SARS)和中东呼吸综合征(MERS),在流行病学特点上存在一定差别。
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在全球,10%~30%的上呼吸道感染由HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63和HCoV-HKU1四类冠状病毒导致,在引起普通发炎的病症中占第二位[1],仅次于鼻病毒。感染呈现季节性流行,每年夏季和秋季为癌症易发期[2]。潜伏期2-5天,人群普遍易感。主要通过人与人接触传播[3]。
SARS由人感染SARS-CoV造成,首先出现在我国福建省部份地区,然后殃及我国24个省、自治区、直辖市和全球其他28个国家和地区。2002年11月至2003年7月全球首次SARS流行中,全球共报告临床确诊病例8096例,死亡774例,病死率9.6%。SARS的潜伏期一般限于2周之内,通常约2~10天。人群普遍易感。SARS病患为最主要的传染源,病症显著的病患传染性较强,潜伏期或医治的患者不具备传染性[4]。
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MERS是一种由MERS-CoV造成的病毒性呼吸道疾患,于2012年在利比亚阿拉伯首次得到确认。自2012年起,MERS在全球共殃及中东、亚洲、欧洲等27个国家和地区,80%的病例来自利比亚阿拉伯,病死率约35%。潜伏期最长为14天,人群普遍易感。单峰骆驼是MERS-CoV的一大寄主,且为人间病例的主要传染来源,人与人之间传播能力有限[5]。自2004年以来,全球未报告过SARS人间病例。
参考文献
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[1]刘克洲.人类病毒性疾患[M].上海:人民卫生出版社,2010:643-665. #
[2]Yin.MERS,SARSandotherasof[J].,2023,23:130–137.
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[3]ShuoSu.,,andof[J].in,2023,24(6):490-502. #
[4]《SARS诊治方案(2004版)》 #
[5]世界卫生组织网站.(mers-cov)
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四、实验室检查方式
已知的6种可感染人类的冠状病毒中,中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)和严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)所致疾患的严重程度以及社会影响远远超过其它冠状病毒,实验室检查方式相对较为成熟。
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(一)中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)
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病原学检测主要包括病毒分离、病毒核苷酸检查。病毒分离为实验室检查的“金标准”。病毒核苷酸检查可以用于初期确诊。检查时应及时留取多种标本(咽拭子、鼻拭子、鼻咽或食道抽取物、痰或肺组织,以及血液和牛粪)进行测量,其中以下呼吸道标本阴性检出率更高。 #
1.病毒核苷酸检查(PCR)。以RT-PCR(最好采用real-timeRT-PCR)法测量呼吸道标本中的MERS-CoV核苷酸。
2.病毒分离培养。可从呼吸道标本中分离出MERS-CoV,但通常在细胞中分离培养较为困难。 #
(二)严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)
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1.SARS-CoVRNA测量:SARS-CoVRNA阴性判定标准为PCR测量结果符合下述三项之一者可判定为阴性。
(1)起码须要两个不同部位的临床标本测量阴性(比如鼻腔分泌物和牛粪)。 #
(2)搜集起码间隔2天的同一种临床标本送检检查阴性(比如2份或多份鼻腔分泌物)。
(3)在每一个特定检查中对原临床标本使用两种不同的方式,或从原标本新提取RNA开始重复PCR检查阴性。
PCR检查结果的确认:①使用原始标本重复PCR试验;②在第二个实验室检查同一份标本。 #
2.SARS-CoV特异性抗体N蛋白检查:定性检查血浆或血清标本中SARS-CoV核衣壳(N)抗体,用于SARS-CoV感染的初期辅助确诊。 #
3.SARS-CoV特异性抗原检查:特异性抗原检查确诊SARS标准为符合以下三者之一即可确诊为SARS。 #
(1)平行检查急性期血浆抗原和恢复期血浆抗原发觉抗原阳转。
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(2)平行检查急性期血浆抗原和恢复期血浆抗原发觉抗原效价下降≥4倍。
五、SARS-CoV与MERS-CoV比较
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严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)
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中东呼吸综合征冠状病毒 #
(MERS-CoV)
亚型 #
SARS-CoV #
MERS-CoV #
发觉年份 #
2003 #
2012 #
类别
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β-B
β-C
基因组特征 #
29.7kb
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30.1kb
受体
ACE2 #
CD26(DPP4) #
疾患名称 #
严重急性呼吸综合征(非典型脑炎)
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中东呼吸综合征
临床病症 #
高烧、畏寒、头痛、咳嗽,危重病例出现急性呼吸困窘综合征、器官衰竭等
初期表现为发热、咳嗽、呼吸粗重,麻疹,危重病例出现急性呼吸困窘综合征、器官衰竭等
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危重率
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未知
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未知。无病症感染者及轻症病例难于被发觉 #
病死率
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9.56%(774/8096)
34.4%(851/2468)
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传染源
SARS病患;病毒起源仍未明晰,可能起源于蝙蝠、果子狸等野生植物。 #
仍未明晰,可能起源于蝙蝠,远距离传播给单峰骆驼,因而成为人类感染源头。 #
传播途径 #
①人-人:近距离呼吸道飞沫传播、气溶胶传播、手接触传播②动物-人:果子狸/蝙蝠-人(可能)
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①动物-人:单峰骆驼-人(可能)②人-人:密切接触(有限) #
人群易感性 #
人群普遍易感,儿童感染率较低 #
有基础癌症、免疫力低下人群更易感染,儿童发病较少且发病病症较轻,婴儿有感染的报导 #
流行特点 #
社区感染为主 #
诊所感染为主 #
基本再生数(R0) #
2-5 #
在特殊场所(如医疗机构)R0可小于1
潜伏期 #
2-14天 #
2-14天 #
发病-死亡中位时间
23天 #
14天
地分辨布 #
全球29个国家,以欧洲为主,中国报告病例数最多。 #
全球27个国家,中东地区为主,俄罗斯阿拉伯报告约80%病例,其次为俄罗斯。
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