如何在这两个数据库查找基因信息，好多网站都可以做到

查找基因信息，很多网站都可以做到。通常常用的精典基因数据库有NCBI、UCSC。下边我们就以BCL2为例看一下怎样在这两个数据库查找基因信息，例如最常查询DNA序列、mRNA序列以及启动子序列、UTR序列甚至蛋白质序列。 #

1F

#

DNA序列 #

1.打开NCBI中Gene选项，输入BCL2后，点击.

2.首先找寻基因DNA序列，如图所示，可以看见基因在染色体定位。 #

3.在一栏中，点击后，可以见到如下界面启动序列，选择send-File-格式后，可以将序列导入到笔记本桌面，这样可以得到基因的DNA序列。在导入序列时有两种格式：格式，由于这个格式提供了好多该基因的信息；FASTA格式只富含基因序列。可以依照需求选择。

2F #

mRNA序列

1.在mRNAand一栏中，可以看见BCL2基因有两个转录本.2和.2 #

2.点击.2启动序列，可以查询基因编码区CDS、以及外显子exon等。

应用小故事(1)

#

例如，近些年来异常火热的cas9技术，是在DNA的水平进行编辑。在验证cas9对基因效率时，通常将突变型与野生型的基因序列交给测序公司，通过剖析测序结果判定基因是否发生突变。而为了实现DNA的水平的突变，在进行设计时都会在mRNA序列中的mRNA序列的外显子上进行设计质粒，为何是外显子呢？由于内含子在翻译过程中被剪切，即使发生序列发生改变，功能也不会改变。

3F #

启动子序列、UTR序列、蛋白序列

#

1.打开UCSC主页，选择物种，输入基因名称。

2.点击GO以后出现以下界面，点击红色标明的BCL2。 #

3.点击后步入以下页面，通过UCSC数据库可以查询该基因的基因组信息，蛋白质数据库相关信息，该基因在不同组织抒发的RNA-seq数据，基因芯片数据，蛋白质功能域以及结构，GO富集剖析等等内容。

#

（1）按照查询目的,例如查询基因启动子、UTR、CDS区，点击。

#

（2）依据需求选择须要查询的内容，同时可以设置UTR、CDS区等，搜索结果会以大小写方式分辨。转录起始位点后面是基因的调控区，启动子区没有显著的位置定义，你们也只是推测它的大体位置，例如你要研究区，建议选择转录起始位点前的2000个核苷酸进行研究。其实假如认为宽度太长，也可以只研究-1000到0这一千个核苷酸，通常情况下，启动子区的变异都在这个区域内。

应用小故事(2)

#

在的研究中，最关键的一步是验证与靶基因是否具有调控关系。可以通过将目的基因3’UTR区域建立至载体年报告基因的旁边，通过比较过抒发或则干扰miRNA后，检测荧光素酶的活性变化而验证报告基因抒发的改变。 #

（3）假如想要查寻蛋白序列，点击即可得到.

#

其实，倘若不满足于获得蛋白质序列，还可以瞧瞧蛋白质功能域与3D结构。 #

应用小故事(3)

蛋白质的许多特点可直接从序列上剖析获得，我们依照序列预测蛋白质功能比较该蛋白序列是否与已知功能的蛋白质相像，或则查找未知蛋白中是否包含与特定蛋白质家族或功能域有关的亚序列或保守区段。

#